骆驼肾髓质抗旱相关基因的筛选

浏览:    时间:2021-03-06 15:51

摘要:骆驼作为一种长期生活在沙漠中的动物,为了适应高温缺水的环境,进化出了抗应激特性。然而,在转录后调控水平上,非编码RNA(ncRNA)介导的骆驼对干旱条件反应的分子调控研究还很

骆驼作为一种长期生活在沙漠中的动物,为了适应高温缺水的环境,进化出了抗应激特性。然而,在转录后调控水平上,非编码RNA(ncRNA)介导的骆驼对干旱条件反应的分子调控研究还很缺乏。在水分胁迫条件下,通过对骆驼肾髓质RNA序列的测定,我们发现了575个选择性剪接事件(ASEs)和17个mRNA、26个miRNA和0个lncRNA。选择下调的LOC105061856、上调的PCBP2和miR-195作为候选抗性相关基因。 缺水胁迫下,骆驼肾髓质中有575例存在显著差异(p<0.05),包括361个内含子(SE)、7个保留内含子(RI)、155个互斥基因(MXE)、27个5′剪接位点(A5SS)和25个3′剪接位点(A3SS)(图1A;表S2-S6)。325、7、149、27和24个蛋白质编码基因分别在SE、RI、MXE、A5SS和3ss酶中被鉴定(图1B;表S2-S6)。

(驼可汗内蒙古骆驼奶招商加盟代理) 比较不同剪接类别之间的蛋白质编码基因,我们发现有35个基因重叠,如SE和A5SS之间的ZNF397和bptf(图1C;表S2-S6)。此外,ASEs富集的分子功能在不同的剪接类型中也表现出明显的差异(p<0.05),包括G-富链端粒DNA结合(GO:0098505)、miRNA结合(GO:0035198)、单链端粒DNA结合(GO:0043047)、端粒DNA结合(GO:0042162),羧酸酯水解酶活性(GO:0052689)、核激素受体结合(GO:0035257)和甲状腺激素受体结合(GO:0046966)(图1D,E)。 图1.缺水胁迫下骆驼肾髓质的选择性剪接。(A) 在不同的选择性表达类别中显著差异的酶的数目;(B)具有显著差异酶的蛋白质编码基因的数目;(C)具有显著差异酶的蛋白质编码基因量的文氏图;(D)具有蛋白质编码的富集显著差异分子功能量的文氏图显著差异酶基因;(E)丰富了显著差异酶蛋白编码基因的分子功能。

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